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酶解or超聲？看小美非接觸超聲波DNA打斷儀如何大顯身手

作者：小美超聲點(diǎn)擊數(shù):3247 更新日期：2022-11-03

在NGS檢測實(shí)驗(yàn)中，DNA文庫構(gòu)建的第一步就是將DNA隨機(jī)打斷成符合各測序平臺讀長的片段。相信熟悉NGS文庫構(gòu)建的科研人員一定糾結(jié)過這個問題，是用酶解打斷還是超聲波打斷？

目前DNA打斷的最主要的方法超聲法和酶解法。但是這兩種方法在實(shí)際使用中各具優(yōu)勢，需要根據(jù)實(shí)驗(yàn)者自身的情況進(jìn)行選擇。

超聲波打斷法：

操作簡單，耗時短，成本低；隨機(jī)片段化，無GC序列偏好；剪切效果不受DNA濃度影響　

片段化結(jié)果集中度高，目的長度片段得率高。

酶切法：

實(shí)驗(yàn)要求嚴(yán)格，針對不同樣本合適的片段化條件摸索不易，成本較高；存在序列偏好性；需要根據(jù)樣本濃度改變酶濃度，酶活性易受到溶液成分影響；目標(biāo)長度片段集中度較低。

超聲打斷法的優(yōu)勢顯而易見，而常用的超聲波打斷儀分為接觸式和非接觸式。相比傳統(tǒng)的探頭超聲波破碎儀，探頭與樣品直接接觸，一次只能處理一個樣品，實(shí)驗(yàn)周期長。小美非接觸超聲波DNA打斷儀Plus系列產(chǎn)品可在密閉容器下進(jìn)行破碎，不產(chǎn)生感染性飛霧，超聲探頭與樣品不接觸，避免交叉污染。對于每天要處理多個樣品或者貴重樣品的實(shí)驗(yàn)室，此款儀器具有處理高通量，樣本低損耗，無交叉污染等優(yōu)勢。逐漸成為ChIP(染色質(zhì)免疫共沉淀)和DNA剪切研究平臺不可缺少的標(biāo)準(zhǔn)化工具。

小美超聲非接觸超聲波DNA打斷儀Plus系列產(chǎn)品具有通量高、實(shí)驗(yàn)一致性好，實(shí)驗(yàn)重復(fù)性好、片段得率高等優(yōu)點(diǎn)。專為二代測序DNA樣本與染色質(zhì)免疫共沉淀實(shí)驗(yàn)樣本前處理量身訂做的，應(yīng)用領(lǐng)域包含：細(xì)菌細(xì)胞破碎、蛋白質(zhì)抽提；二代測序樣本DNA片段化；霉菌孢子破碎、乳化、均質(zhì)、加速溶解、催化反應(yīng)等。